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面向水质安全保障与江河保护开发的国家重大需求，提出基于“河流全物质通量”的科学概念、方法体系和流域综合治理模式。在国内外首次完成了长江、黄河、西南源区等世界性大河及全国地下水的全要素同步监测，完善了河流水环境全要素基础样品库与大数据平台建设，引领了国际大河研究的发展。突破城镇、工业和农村污水排放关键控制技术瓶颈，开发和形成了解决河流多功能协调的全链条治理关键技术体系与方案，在山西、河北、山东、天津、四川等15个省市推广应用，累计处理水量逾100万m3/d，支撑了国家重点流域、国内重要城市群河湖、全国农村饮水安全工程、国家南水北调工程、雄安新区、珠江后航道和长江黄金航道的生态环境治理，直接受益人口超过1200万人。
全要素监测-检测指标体系
全国地下水中病毒分类单位（vOTUs）地域分布
